Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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HCN4Q9Y3Q4 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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HCN4Q9Y3Q4 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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HCN4Q9Y3Q4 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HCN4Q9Y3Q4 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
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HCN4Q9Y3Q4 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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HCN4Q9Y3Q4 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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HCN4Q9Y3Q4 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HCN4Q9Y3Q4 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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