Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TPRNQ4KMQ1 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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