Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NTRK2Q16620 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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NTRK2Q16620 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NTRK2Q16620 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NTRK2Q16620 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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