Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEC23AQ15436 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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