Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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