Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SSPNQ14714 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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