Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SCARF1Q14162 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms