Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
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UBE4AQ14139 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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UBE4AQ14139 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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UBE4AQ14139 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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