Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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MKRN4PQ13434 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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MKRN4PQ13434 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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MKRN4PQ13434 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
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MKRN4PQ13434 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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MKRN4PQ13434 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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MKRN4PQ13434 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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MKRN4PQ13434 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN4PQ13434 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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