Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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