Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SEMA3FQ13275 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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