Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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