Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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