Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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PTPRNQ16849 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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PTPRNQ16849 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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PTPRNQ16849 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PTPRNQ16849 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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