Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNAPC1Q16533 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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