Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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CCDC6Q16204 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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CCDC6Q16204 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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CCDC6Q16204 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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CCDC6Q16204 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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CCDC6Q16204 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CCDC6Q16204 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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