Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
MKRN4PQ13434 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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