Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SGCGQ13326 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SGCGQ13326 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCGQ13326 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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