Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CLN3Q13286 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms