Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms