Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TFCP2Q12800 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TFCP2Q12800 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms