Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SHANK2Q9UPX8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SHANK2Q9UPX8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms