Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PNMA8BQ9ULN7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms