Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GGA1Q9UJY5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GGA1Q9UJY5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms