Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EHD3Q9NZN3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms