Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms