Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU23

LYRM2, LYR motif-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM2Q9NU23 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYRM2Q9NU23 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms