Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFA4L2Q9NRX3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms