Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TULP4Q9NRJ4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms