Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARHGEF3Q9NR81 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms