Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms