Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD3Q9H7E2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD3Q9H7E2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms