Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 LINC01965-201ENST00000412112 1378 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AC015818.2-201ENST00000563569 840 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AC021546.1-201ENST00000518927 1031 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 C11orf65-203ENST00000525729 1263 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SENP3Q9H4L4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 IL31RA-208ENST00000611895 1171 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SENP3Q9H4L4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms