Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR88Q9GZN0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR88Q9GZN0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms