Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK3Q9BYB0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms