Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGIP1Q9BQI5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms