Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LYSTQ99698 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LYSTQ99698 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms