Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3AQ96ST3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms