Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms