Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC43Q96MW1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC43Q96MW1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms