Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EP400Q96L91 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EP400Q96L91 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms