Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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MS4A4AQ96JQ5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MS4A4AQ96JQ5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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MS4A4AQ96JQ5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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MS4A4AQ96JQ5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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MS4A4AQ96JQ5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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MS4A4AQ96JQ5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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MS4A4AQ96JQ5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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MS4A4AQ96JQ5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A4AQ96JQ5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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