Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCC12Q96J65 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms