Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN37Q96GY3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms