Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCANQ96GW7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms