Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NEO1Q92859 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NEO1Q92859 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms