Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC12Q8WUD4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC12Q8WUD4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms