Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPBAR1Q8TDU6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms