Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC82Q8N4S0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC82Q8N4S0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms