Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC47Q8N1G4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC47Q8N1G4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC47Q8N1G4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC47Q8N1G4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC47Q8N1G4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms